Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Hoxd12P23812 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Hoxd12P23812 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms