Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Pde6bP23440 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pde6bP23440 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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