Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PrkchP23298 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PrkchP23298 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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