Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ms4a2P20490 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms