Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtpraP18052 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms