Protein–RNA interactions for Protein: P11103

Parp1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp1P11103 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp1P11103 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Parp1P11103 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms