Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Hoxd3P09027 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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