Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
H2-Ab1P01921 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms