Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
BlmO88700 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BlmO88700 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BlmO88700 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BlmO88700 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BlmO88700 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BlmO88700 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms