Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
AurkcO88445 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AurkcO88445 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms