Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Copb2O55029 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Copb2O55029 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms