Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sdc4O35988 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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