Protein–RNA interactions for Protein: O35309

Nmi, N-myc-interactor, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmiO35309 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NmiO35309 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NmiO35309 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NmiO35309 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NmiO35309 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NmiO35309 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NmiO35309 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NmiO35309 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NmiO35309 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NmiO35309 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms