Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Usp35M0QWN7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms