Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm20878L7N244 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms