Protein–RNA interactions for Protein: J3QK56

4930544D05Rik, RIKEN cDNA 4930544D05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930544D05RikJ3QK56 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.02■□□□□ -0
4930544D05RikJ3QK56 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
4930544D05RikJ3QK56 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms