Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ankrd35E9Q9D8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms