Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Urb2E9Q7L1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms