Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc85cE9Q6B2 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85cE9Q6B2 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85cE9Q6B2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85cE9Q6B2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85cE9Q6B2 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85cE9Q6B2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85cE9Q6B2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms