Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Ccdc71lE9Q4T4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ccdc71lE9Q4T4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ccdc71lE9Q4T4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Ccdc71lE9Q4T4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ccdc71lE9Q4T4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Ccdc71lE9Q4T4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Ccdc71lE9Q4T4 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Ccdc71lE9Q4T4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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