Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Pdzd2E9Q1M1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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