Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krt78E9Q0F0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krt78E9Q0F0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms