Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clca3bE9PUL3 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms