Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim30cD3YVI9 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim30cD3YVI9 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 340.5 ms