Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Phf11bB4XVQ1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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