Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Usf3B2RUQ2 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Usf3B2RUQ2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms