Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rrn3B2RS91 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rrn3B2RS91 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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