Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms