Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Spocd1B1ASB6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spocd1B1ASB6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92 ms