Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Odf2A3KGV1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms