Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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