Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ttll9A2APC3 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms