Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Pfdn5Q9WU28 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Pfdn5Q9WU28 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms