Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms