Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Fscn3Q9QXW4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Fscn3Q9QXW4 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Fscn3Q9QXW4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
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Fscn3Q9QXW4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Fscn3Q9QXW4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fscn3Q9QXW4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fscn3Q9QXW4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fscn3Q9QXW4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fscn3Q9QXW4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Fscn3Q9QXW4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Fscn3Q9QXW4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
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