Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Homer2Q9QWW1 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Homer2Q9QWW1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms