Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prg3Q9JL95 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Prg3Q9JL95 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prg3Q9JL95 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prg3Q9JL95 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prg3Q9JL95 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prg3Q9JL95 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Prg3Q9JL95 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prg3Q9JL95 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms