Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hmgn5Q9JL35 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms