Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Kcnq4Q9JK97 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Kcnq4Q9JK97 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Kcnq4Q9JK97 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Kcnq4Q9JK97 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Kcnq4Q9JK97 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Kcnq4Q9JK97 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kcnq4Q9JK97 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms