Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Usp29Q9ES63 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp29Q9ES63 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp29Q9ES63 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp29Q9ES63 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms