Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Slc28a3Q9ERH8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Slc28a3Q9ERH8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms