Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SgshQ9EQ08 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SgshQ9EQ08 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SgshQ9EQ08 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SgshQ9EQ08 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SgshQ9EQ08 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SgshQ9EQ08 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SgshQ9EQ08 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SgshQ9EQ08 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms