Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pop5Q9DB28 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms