Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Cmtm2bQ9DAC0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms