Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Subh2bvQ9D9Z7 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms