Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gtf3c6Q9D8P7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gtf3c6Q9D8P7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms