Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Echdc3Q9D7J9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Echdc3Q9D7J9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Echdc3Q9D7J9 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Echdc3Q9D7J9 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Echdc3Q9D7J9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Echdc3Q9D7J9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Echdc3Q9D7J9 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Echdc3Q9D7J9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Echdc3Q9D7J9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Echdc3Q9D7J9 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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