Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q9D727 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q9D727 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q9D727 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms