Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Krt34Q9D646 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms