Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Trappc6bQ9D289 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Trappc6bQ9D289 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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Trappc6bQ9D289 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Trappc6bQ9D289 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Trappc6bQ9D289 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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Trappc6bQ9D289 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Trappc6bQ9D289 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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